本研究方向主要从事森林病虫害防治、外来入侵有害生物防治、森林土壤微生物多样性及森林真菌资源利用等方面的研究工作。本研究方向团队已主持完成9项国家自然科学基金项目，尤其在不同生态条件下土壤真菌生物多样性、外来生物三裂叶豚草的生物防治、经济林/园林植物病害防治、农作物病害防治、民族地区真菌生物资源利用（传统特色食品真菌、食用菌栽培、真菌生物转化）、植物病原真菌分类（腔孢菌、镰孢菌）等领域开展了较多研究工作。近年来不断关注气候变化条件下真菌生物多样性、森林病害发生规律和侵染机制、食用菌适应性遗传变异机制等方面的研究工作。本研究方向已培养10余名博士生和60余名硕士生及2名博士后。本研究方向与美国、加拿大、英国、德国、法国、荷兰、俄罗斯、日本、韩国等国外相关研究机构或同行已开展了密切的学术交流活动，与台湾同行也保持密切的学术联系。

森林保护与管理是林业生产的重要组成部分，对于建设和保护森林生态系统具有特别重要意义。随着我国生态文明建设、社会主义新农村建设、城市园林建设以及生物多样性保护等事业的快速发展，森林病虫害防治及森林（包括经济林）生态系统保护和可持续发展将愈发显现其重要性。本研究方向将致力于培养具有现代生物学[特别是植物学、林学、微生物学、植物(森林)病理学]知识和理论并掌握前沿技术的高素质林业科技人才。